鼠疫菌基因组差异编码序列的筛选研究
作者：赵忠智%张恩民%唐新元%俞东征%粱莹%张志凯%海荣%王梅%申小娜
单位：青海省地方病预防控制所青海省鼠疫防控与研究重点实验室%中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室%WANG Mei%TANG Xin-yuan%LIANG Ying%ZHANG Zhi-kai%ZHANG En-min%SHEN Xiao-na%ZHAO Zhong-zhi%YU Dong-zhen%HAI Rong%Key Laboratory for Plague Prevention and Control of Qinghai Province，Qinghai Institu
目的对喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地2株青藏高原型已测序鼠疫耶尔森菌株的全基因组编码序列进行比对，寻找青藏高原型鼠疫菌中存在的差异编码序列.方法应用BLAST软件、Perl编程及Excel软件等，对青藏高原型全基因测序鼠疫耶尔森菌株与测序鼠疫菌"默认编码序列数据库"进行编码序列比对和统计分析.结果初步比对喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地2株青藏高原型鼠疫菌编码序列有418个差异编码序列，其与鼠疫菌"默认编码序列数据库"中存在差异的编码序列有135个，最终确定在鼠疫菌全基因组数据库中真实有差异的编码序列共86个.结论喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地2株青藏高原型鼠疫菌编码序列存在差异，真实有差异的编码序列是鼠疫菌存在差异的编码序列集合，为研究青藏高原型鼠疫菌的遗传特征提供了资料信息.
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