项目通过对青海省1954——2012年间不同地区、宿主、媒介体内分离的952株鼠疫菌生物学特性、分子流行病学特征及空间分布规律的研究，确定了青海省鼠疫菌的生态型为青藏高原型（ 91.49%,～ 871/952),祁连山型（6.41%, 61/952),青海田鼠型（1.26%, 12/952)； 83.6%(796/952）的鼠疫菌四个毒力因子俱全（Fl十、PstI十、vw十、Pgm十）；其毒力检测结果显示，93.26%(367/392)的鼠疫菌为强毒菌；青海高原鼠疫疫源地内动物鼠疫连年不断，人间鼠疫以重型鼠疫为多，病死率高，这些都与青海高原的鼠疫菌毒力强、毒力因子俱全的菌株多有关。通过对鼠疫菌DFR分型，证实共有1b、5、7、8、10、14、21、新型等8个基因组型，其中喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地以5、8型为主，青海田鼠鼠疫疫源地全为14型，该研究成果对现场流行病学调查、菌种鉴定、病原体溯源等具有非常重要意义。